个人所得税重复缴纳，可通过税务局网站或APP申请退税。分析说明：根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，纳税人依法享有申请退税的权利。当发现个人所得税被重复缴纳时，即多预缴了税款，纳税人有权向税务机关申请退税。这是法律赋予纳税人的合法权益，税务机关在核实情况后会依法办理退税手续。提醒：如果退税申请长时间未被处理，或者税务机关拒绝退税理由不充分，可能表明问题比较严重，建议及时寻求专业律师或税务顾问的协助。
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处理方式：个人所得税重复缴纳申请退税的常见方式主要有三种。选择建议：纳税人可以根据自身情况选择合适的方式。如果熟悉税务操作，可以选择自行办理；如果不方便自行操作，可以请任职单位代为办理；若希望更专业地处理，可以委托涉税专业服务机构办理。
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具体操作如下：1.自行办理：登录税务局官方网站或个人所得税APP，选择“综合所得年度汇算”模块，按照提示填写相关信息，确认已缴税额后提交退税申请。2.通过扣缴义务人代为办理：与任职单位财务部门联系，提供重复缴纳税款的证据，请其协助办理退税手续。3.委托涉税专业服务机构办理：与机构签订授权委托书，提供必要的个人信息和缴税记录，由机构代为向税务机关提交退税申请。在处理过程中，纳税人应确保提供的材料真实、准确、完整，以便税务机关快速审核并办理退税。同时，关注退税进度，如有需要，及时与税务机关沟通。