首先，关于《公司法》中决定董事长工资的部门，一般由董事会决定。其次，根据《公司法》第四十六条，董事会对董事的报酬事项作出决议，此为公司内部治理事项，**除公司章程另有规定外**。若公司章程有明确规定，则按章程规定执行；若公司章程未明确规定，则依据《公司法》第四十六条，由股东会决定。因此，决定董事长工资的的部门属于公司内部人事管理范畴，通常由董事会根据公司实际情况及董事职责来决策。最后，不及时明确董事长工资决定部门，可能影响公司内部管理秩序及董事工作积极性，甚至引发内部矛盾。
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决定董事长工资的部门为董事会。具体处理：1.查看公司章程是否有特别约定；2.若无，则按《公司法》由股东会按出资比例表决；3.董事会执行股东会决议，确定董事长工资部门及标准。
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首先，关于决定董事长工资的部门，法律上一般由董事会负责。其次，处理方式包括：1.查阅公司章程，看是否有特别规定；2.若无特别规定，则遵循《公司法》由股东会决定；3.董事会根据股东会决议或公司实际情况制定具体方案。在选择处理方式时，应先检查公司章程，遵循其中规定的程序，若无具体规定，则按《公司法》规定的股东会决策流程进行。